add varous charts
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Anton Nesterov
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8b44d43c83
commit
9b7944fb4e
14
expr.ts
14
expr.ts
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@ -1,9 +1,9 @@
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import pl from "npm:nodejs-polars"
|
import pl from "npm:nodejs-polars";
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||||||
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||||||
export function residuals(x: pl.Expr, y: pl.Expr): pl.Expr {
|
export function residuals(x: pl.Expr, y: pl.Expr): pl.Expr {
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const xM = x.minus(x.mean())
|
const xM = x.minus(x.mean());
|
||||||
const yM = y.minus(y.mean())
|
const yM = y.minus(y.mean());
|
||||||
const xMSQ = xM.pow(2)
|
const xMSQ = xM.pow(2);
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const beta = xM.dot(yM).div(xMSQ.sum())
|
const beta = xM.dot(yM).div(xMSQ.sum());
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return yM.minus(beta.mul(xM))
|
return yM.minus(beta.mul(xM));
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}
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}
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217
plots.ts
217
plots.ts
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@ -1,28 +1,35 @@
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import * as _Plot from "npm:@observablehq/plot";
|
import * as _Plot from "npm:@observablehq/plot";
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import { DOMParser, SVGElement } from "npm:linkedom";
|
import { DOMParser, SVGElement } from "npm:linkedom";
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||||||
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import * as _vega from "npm:vega";
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||||||
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import * as _lite from "npm:vega-lite";
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const defaultPlotSettings = {
|
const defaultPlotSettings = {
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grid: true,
|
grid: true,
|
||||||
margin: 50,
|
margin: 50,
|
||||||
style: {
|
style: {
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backgroundColor: "#fff"
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backgroundColor: "#fff",
|
||||||
}
|
},
|
||||||
}
|
};
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/**
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/**
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* Configure default plot settings
|
* Configure default plot settings
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* @param options
|
* @param options
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*/
|
*/
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||||||
export function configurePlots(options: any) {
|
export function configurePlots(options: any) {
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Object.assign(defaultPlotSettings, options)
|
Object.assign(defaultPlotSettings, options);
|
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}
|
}
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||||||
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export const document = new DOMParser().parseFromString(`<!DOCTYPE html><html></html>`, "text/html");
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export const document = new DOMParser().parseFromString(
|
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`<!DOCTYPE html><html></html>`,
|
||||||
|
"text/html",
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||||||
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);
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export const Plot = _Plot;
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export const Plot = _Plot;
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||||||
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export const vega = _vega;
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export const vegalite = _lite;
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/**
|
/**
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||||||
* Draw side-by-side plots
|
* Draw side-by-side plots
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||||||
* Example:
|
* Example:
|
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* ```ts
|
* ```ts
|
||||||
* const plt = sideBySidePlot({
|
* const plt = sideBySidePlot({
|
||||||
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@ -39,34 +46,168 @@ export const Plot = _Plot;
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||||||
* @param marks List of plot callbacks
|
* @param marks List of plot callbacks
|
||||||
* @param cols Number of columns
|
* @param cols Number of columns
|
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*/
|
*/
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||||||
export function sideBySidePlot(opts: {
|
export function sideBySidePlot(opts: {
|
||||||
x: string[],
|
x: string[];
|
||||||
y: string[],
|
y: string[];
|
||||||
marks: any[]
|
marks: any[];
|
||||||
cols: number,
|
cols: number;
|
||||||
options,
|
options;
|
||||||
}) {
|
}) {
|
||||||
const imgTags: string[] = []
|
const imgTags: string[] = [];
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||||||
for (const xTarget of opts.x) {
|
for (const xTarget of opts.x) {
|
||||||
for (const yTarget of opts.y) {
|
for (const yTarget of opts.y) {
|
||||||
const plt = Plot.plot({
|
const plt = Plot.plot({
|
||||||
...(opts.options ?? defaultPlotSettings),
|
...(opts.options ?? defaultPlotSettings),
|
||||||
marks: opts.marks.map(fn => fn(xTarget, yTarget)),
|
marks: opts.marks.map((fn) => fn(xTarget, yTarget)),
|
||||||
document
|
document,
|
||||||
})
|
});
|
||||||
plt.setAttribute('xmlns', 'http://www.w3.org/2000/svg')
|
plt.setAttribute("xmlns", "http://www.w3.org/2000/svg");
|
||||||
const svgUrl = `data:image/svg+xml;base64,${btoa(unescape(encodeURIComponent(plt)))}`
|
const svgUrl = `data:image/svg+xml;base64,${
|
||||||
imgTags.push(`<img title="${xTarget} / ${yTarget}" src='${svgUrl}'>`)
|
btoa(unescape(encodeURIComponent(plt)))
|
||||||
}
|
}`;
|
||||||
|
imgTags.push(`<img title="${xTarget} / ${yTarget}" src='${svgUrl}'>`);
|
||||||
}
|
}
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||||||
const output = `
|
}
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||||||
<section style="display:grid;grid-template-columns: repeat(${opts.cols ?? 2}, 1fr);">
|
const output = `
|
||||||
${imgTags.join('')}
|
<section style="display:grid;grid-template-columns: repeat(${
|
||||||
|
opts.cols ?? 2
|
||||||
|
}, 1fr);">
|
||||||
|
${imgTags.join("")}
|
||||||
</section>
|
</section>
|
||||||
`
|
`;
|
||||||
return {
|
return {
|
||||||
[Symbol.for("Jupyter.display")]: () => ({
|
[Symbol.for("Jupyter.display")]: () => ({
|
||||||
"text/html": output
|
"text/html": output,
|
||||||
})
|
}),
|
||||||
}
|
};
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
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|
/**
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|
* Histogram plot
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|
*
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|
* @param data
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* @param x
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|
* @param opts
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|
* @returns Plot
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|
*/
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export function histPlot(
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|
data: any[],
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|
x = "column",
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|
opts = { options: null, fn: "proportion" },
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|
) {
|
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|
return Plot.plot({
|
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|
...(opts.options ?? defaultPlotSettings),
|
||||||
|
y: { grid: true },
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||||||
|
marks: [
|
||||||
|
Plot.ruleY([0]),
|
||||||
|
Plot.ruleX([0]),
|
||||||
|
Plot.rectY(data, Plot.binX({ y: opts.fn ?? "count" }, { x: x })),
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|
],
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|
document,
|
||||||
|
});
|
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|
}
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export function oneBoxPlot(
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data: any[],
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|
y = "column",
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|
opts = { options: null, box: null },
|
||||||
|
) {
|
||||||
|
return Plot.plot({
|
||||||
|
...(opts.options ?? defaultPlotSettings),
|
||||||
|
y: { grid: true },
|
||||||
|
marks: [
|
||||||
|
Plot.ruleY([0]),
|
||||||
|
Plot.boxY(data, { y, ...(opts.box ?? {}) }),
|
||||||
|
],
|
||||||
|
document,
|
||||||
|
});
|
||||||
|
}
|
||||||
|
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export async function quantilePlotSVG(
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|
data: any[],
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x = "column",
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|
opts = { width: 500 },
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|
) {
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|
const spec = {
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|
data: { values: data },
|
||||||
|
width: opts.width,
|
||||||
|
"transform": [
|
||||||
|
{
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||||||
|
"quantile": "price",
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||||||
|
"as": ["prob", "value"],
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
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||||||
|
"calculate": "quantileNormal(datum.prob)",
|
||||||
|
"as": "norm",
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|
},
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||||||
|
],
|
||||||
|
"layer": [
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|
{
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||||||
|
"mark": { type: "circle", size: 80 },
|
||||||
|
"encoding": {
|
||||||
|
"x": {
|
||||||
|
"field": "norm",
|
||||||
|
"type": "quantitative",
|
||||||
|
"title": "Theoretical Quantiles→",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"y": {
|
||||||
|
"field": "value",
|
||||||
|
"type": "quantitative",
|
||||||
|
"title": "Ordered Values→",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
mark: { type: "line", color: "red" },
|
||||||
|
transform: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"regression": "value",
|
||||||
|
"on": "norm",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"encoding": {
|
||||||
|
"x": { "field": "norm", "type": "quantitative" },
|
||||||
|
"y": { "field": "value", "type": "quantitative" },
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
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|
};
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|
let vegaspec = vegalite.compile(spec).spec;
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|
var view = new vega.View(vega.parse(vegaspec), { renderer: "none" });
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|
return await view.toSVG();
|
||||||
|
}
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||||||
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|
export function quantilePlot(data: any[], x = "column", opts = { width: 500 }) {
|
||||||
|
return {
|
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|
[Symbol.for("Jupyter.display")]: async () => ({
|
||||||
|
"text/html": await quantilePlotSVG(data, x, opts),
|
||||||
|
}),
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
const svgDataUrl = (plt) =>
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|
`data:image/svg+xml;base64,${btoa(unescape(encodeURIComponent(plt)))}`;
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|
export function threeChart(data: any[], x = "column", opts = { width: 800 }) {
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|
const hist = histPlot(data, x);
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|
hist.setAttribute("xmlns", "http://www.w3.org/2000/svg");
|
||||||
|
const box = oneBoxPlot(data, x);
|
||||||
|
box.setAttribute("xmlns", "http://www.w3.org/2000/svg");
|
||||||
|
const qq = quantilePlotSVG(data, x);
|
||||||
|
return {
|
||||||
|
[Symbol.for("Jupyter.display")]: async () => ({
|
||||||
|
"text/html": `
|
||||||
|
<section style="display:flex;flex-direction: column; gap: 1em;">
|
||||||
|
<div style="gap:0.5em; display:flex; flex-direction: row; border: 1px solid black;">
|
||||||
|
<img src="${svgDataUrl(hist)}" style="width: 100%;">
|
||||||
|
<img src="${svgDataUrl(box)}" style="width: 65%">
|
||||||
|
</div>
|
||||||
|
<div style="padding:1em; border: 1px solid black;">
|
||||||
|
<img src="${svgDataUrl(await qq)}" style="width: 100%">
|
||||||
|
</div>
|
||||||
|
</section>
|
||||||
|
`,
|
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|
}),
|
||||||
|
};
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||||||
|
}
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